整肠丸一般指和胃整肠丸，保济丸和和胃整肠丸的区别在于药物成分、功效差异、适用范围不同，虽然两种药物都有治疗消化不良、腹痛腹泻等肠胃等不适症状，但是成分和治疗都有明显的区别。
一、药物成分不同：
1、保济丸：保济丸是由钩藤、蒺藜、菊花、厚朴、苍术，以及天花粉、广藿香、化橘红、薏苡仁、谷芽等药物组成；
2、和胃整肠丸：和胃整肠丸是由颠茄提取物、木馏油、甘草、肉桂、丁香、水杨酸苯酯、薄荷脑组成。
二、功效不同：
1、保济丸：保济丸具有解表、祛湿、和中的功效，主要用于暑湿感冒引起的发热、头痛、腹痛、腹泻、恶心、呕吐、肠胃不适等症状，对于调节脾胃助消化、减少腹胀、腹泻等情况有一定的治疗效果；
2、和胃整肠丸：和胃整肠丸一般有温中和胃、理气止痛的效果，用于邪滞中焦所引起的的恶心、胃痛、呕吐、纳差、泄泻、腹痛、胃胀、腹胀的症状，可减少大便的水分，帮助治疗腹泻、腹痛的症状。
三、适用范围不同：
1、保济丸：保济丸主要是用于饮食上，如吃得太多、太杂、油腻等所导致的不消化，肠胃不适拉肚子的症状，还对于晕船、晕车有一定的辅助缓解作用；
2、和胃整肠丸：和胃整肠丸主要是针对于饮食上消化不良、食物不当导致的腹痛、腹泻，有止泻、止疼的作用。
如果患者需要服用药物，要在医生的指导下选择合适的药物针对性的治疗出现的症状，可以使患者的身体尽快恢复。