细菌前列腺炎和无菌前列腺炎主要的区别点就在于细菌性前列腺炎的病变是细菌感染所造成的。因此在细菌学检查时，尤其是在做前列腺液检查的时候，可能会发现前列腺液中的白细胞显著地上升。
另外，对前列腺液做细菌培养的时候，也会发现有致病性的细菌。无菌性前列腺炎的患者前列腺液中白细胞是正常的，也不会培养出致病的细菌。
因为一般前列腺液约占精液中液体成分的85%以上，所以如果患者无法取出前列腺液，可以做精液常规的检测，看精液常规中有没有大量的白细胞，或者是做精液的细菌培养，再加药物敏感试验。如果精液中出现了大量的细菌可以替代前列腺液诊断，验证为有细菌性的前列腺炎。
在临床症状上，无论是排尿不畅的症状，还是前列腺炎导致的盆底疼痛不适的症状，细菌性的前列腺炎和无菌性的前列腺炎几乎类似。所以光凭症状是无法区分的，关键还是要看实验室的检测。