偏头痛预防性治疗药物种类繁多，如果有指征应该从中选择证实有效的一线药物。同时需要注意药物的不良反应，患者的喜好以及伴发疾病的影响。
在众多的推荐药物之中，证据最充足的是β受体阻滞剂，代表性的药物是普萘洛尔，能减少一半以上的患者发作频率。其副作用可能会造成心率减慢，血压降低，还有可能诱发哮喘、房室传导阻滞等。
第二大类药物是抗抑郁药，三环类抗抑郁药中只有阿米替林被证实治疗可治疗偏头痛。第三种药物是钙离子通道阻滞剂，其作用机理可能与抑制5-羟色胺神经递质释放有很大关系，代表性的药物包括氟桂利嗪。
第四种药物是抗惊厥药，代表性药物是丙戊酸钠缓释片和托吡酯片，这两个药物是被美国FDA批准用于偏头痛的预防性的药物。