首先需知道淋病奈瑟菌主要是通过性生活传播的一种致病菌，它是阴性球菌，革兰氏染色是一种染色方法，用此种染色方法来染色观察有无革兰氏阴性双球菌。
因淋病奈瑟菌是一种阴性双球菌，染色后在显微镜下观察较易找到，淋病奈瑟菌在镜下通常为急性感染，在中性粒细胞内形成一小堆阴性球菌，染成粉红色，可看得到，所以涂片若有一小堆成双成对的红色球菌，如果是来源于泌尿系统，则极有可能是淋病菌感染，但这只是从形态上鉴别，不能百分百肯定是淋病奈瑟菌。
如果想知道它是否为淋病奈瑟菌，需通过培养和鉴定才可确定它是淋病奈瑟菌，从涂片上无法知道，只是主观认为，经验性认为可能是淋病奈瑟菌，如果涂片较快且方便，结果做得较快，则治疗也较快。