乳糖不耐受分继发和先天性，继发性者可继发于腹泻引起的乳糖酶破坏，为暂时性。无论继发和先天性，建议暂时停止母乳喂养，待肠道乳糖酶恢复后仍可母乳喂养。乳糖不耐受症，除了引发腹胀腹痛等腹部不适症状外，还可造成宝宝营养吸收不良，减少钙的摄入，造成小儿严重缺钙，乳糖不耐受，还可影响宝宝铁和锌的吸收，直接影响宝宝的正常生长发育，特别是有可能影响宝宝的脑发育。
如果是服用牛奶乳糖不耐受的宝宝，不要以牛奶制品为主要食物来源，可以选择除乳糖的牛奶粉、酸奶、豆奶、羊奶粉、羊奶等。如果是先天性乳糖不耐受，则不能食用母乳和含有乳糖的食物。