金黄色葡萄球菌感染症状分为两种：
第一种是化脓性感染，包括局部组织化脓、内脏器官化脓或者全身性化脓感染。局部组织化脓表现为疖、痈、甲沟炎、麦粒肿、蜂窝织炎、伤口化脓等，特点是脓液呈金黄色，并且比较黏稠，界限分明。内脏化脓感染，如肺炎、脓胸、中耳炎、脑膜炎、心包炎、心内膜炎等。全身化脓感染，如败血症、脓毒血症等。
第二种是毒素性疾病，金黄色葡萄球菌会产生毒素导致人生病，不属于化脓性感染，主要有三种：
一、食物中毒，人吃了含有肠毒素的食物后，1-6小时会出现头晕、恶心、呕吐、腹泻等急性胃肠炎的症状，通常1-2天内就能自行恢复。
二、烫伤样皮肤综合征，是金黄色葡萄球菌产生的表皮剥脱毒素引起，常见于新生儿，皮肤出现弥漫性红疹、起皱，形成水疱，导致表皮脱落，如果再继发细菌感染，可引起死亡。
三、毒性休克综合征，主要表现为高烧、低血压、呕吐、腹泻、全身弥漫性红色皮疹，严重者出现休克。