骶管囊肿不是肿瘤，而是骶管内的一种水囊性病变。大多数患者无症状，但有症状的患者由于骶管囊肿常会压迫骶神经根，所以会引起神经根支配区的疼痛，主要表现为下腰部疼痛、臀部疼痛、尾骨和骶骨疼痛、会阴部和外生殖器疼痛、骨盆部位疼痛、腹股沟区疼痛、髋关节外侧疼痛。另外下肢即大腿和小腿的外侧后方，以及脚部等，都是骶神经根分布的区域，也可能发生疼痛。
除疼痛外，骶管囊肿还会引起局部感觉异常，包括会阴部、腿部、脚部的麻木、发冷、发热等，还可以引起腿部肌肉痉挛、脚趾和肛门括约肌不自主抽动、行走困难，甚至出现神经源性跛行。部分患者还会出现直肠、肛门的功能障碍，表现为便秘、大便急迫、便失禁、肛门疼痛。也可能出现性功能障碍，如男性患者出现阳痿和阴茎疼痛、同房疼痛等症状；女性患者可以出现持续性性兴奋综合征，主要表现为在没有任何性刺激的情况下反复出现性高潮。
骶管囊肿的症状分布比较广泛，临床上常会造成漏诊和误诊，一部分患者可能长期在泌尿外科、妇产科、肛肠科等科室进行诊治。对于有这些症状的患者，在治疗一段时间之后如果效果不理想，应该及时进行腰骶椎磁共振检查，明确是否患有骶管囊肿。一旦诊断明确后，应该及时到神经外科接受药物或手术治疗，使症状尽快改善，恢复健康。