内生肌酐清除率偏低可以给予排毒的药物来治疗，同时要从病因上进行处理。内生肌酐清除率偏低也就是肾功能衰竭。患者主要的表现就是毒素水平的升高，以肌酐和尿素为代表性。这时候肾脏的排毒能力是下降的可以用药物来帮助排毒，比如尿毒清颗粒、海昆肾喜胶囊、肾康栓等等。
在上述对症处理的同时一定要寻找基础的病因，从病因上进行处理。只有从病因上进行处理，肾功能才能恶化的慢一些。比如，如果是糖尿病引起的就需要控制血糖、高血压引起的就需要控制血压。如果是狼疮引起的就需要应用激素和免疫抑制剂来治疗。同时在生活中还需要避免肾功能加重的因素，比如饮食不洁导致呕吐腹泻、不注意保暖出现了感冒发热等等。