治小脑萎缩最好的药，需要根据导致小脑萎缩的原因来决定。部分患者可能由于小脑梗死导致，则需要服用药物抗血小板聚集的药物，部分患者可能由于小脑出血、小脑肿瘤等原因导致。
1、小脑梗死：导致的小脑萎缩，可以用脑梗死的药，如抗血小板聚集的药，阿司匹林、氯吡格雷等以及他汀类降脂药，后期主要是进行康复治疗。
2、小脑出血：此原因导致的小脑萎缩，患者急性期需要对症止血以及控制血压，后期也是给予康复治疗。
3、小脑肿瘤：通常使用的药物是对症支持的，如患者有肢体麻木，可以给予营养神经的药物，必要时需要给予手术来去根。
4、神经系统变性疾病：此原因导致的小脑萎缩，例如皮质基底节变性、进行性核上麻痹、多系统萎缩等。此类患者并无特效药，主要也是针对患者的症状，给予相应的治疗，可以用能量合剂以及营养神经的药，例如B族维生素等。