ERCP手术后5年一般不会再出现远期并发症。ERCP最常见的远期并发症就是肠液反流。因为ERCP手术要切开壶腹部的括约肌，当切开过大时，可能会破坏括约肌的功能。括约肌的功能主要是防止食物或者残液逆流进入胆道，保证只有胆汁能够排出进入肠道，是单向阀门。
如果在切开过程中，损伤了括约功能，有可能会导致单向阀门变成双向阀门，这种情况就会引起反复的胆道感染症状，如出现腹痛、黄疸、发热、畏冷等表现。一般如果经过5年时间，没有出现任何异常，括约肌会逐步地修复，一般不会出现远期并发症。
ERCP手术后要定期复查随访，检查胆管是否有 出现相关异常，比如有没有胆道、胆管炎症改变，胆管壁的增厚或者胆管狭窄等情况，以及术后是否出现发热等表现。