Barrett食管可以根治，一般通过内镜治疗和手术治疗就可以达到治愈目的。但并不是一旦诊断为Barrett食管，都需要进行内镜和手术治疗。我国Barrett食管癌变率在0.61%左右，所以一般Barrett食管症状比较轻，病理类型不伴有异型增生的，首先建议生活方式干预、药物治疗，尽量把症状减少，然后定期复查。
如果Barrett食管病理提示有低级别或高级别上皮内瘤变，建议内镜下切除或内镜下射频消融，除内镜治疗以外，部分需要手术治疗。综上，Barrett食管只有发生了异型增生，手术治疗和内镜治疗才算根治，但不是所有的Barrett食管都需要进行根治。