卵巢透明细胞癌的来源与卵巢子宫内膜异位症相关。目前认为卵巢子宫内膜异位症可以发生恶变，分为子宫内膜样癌、透明细胞癌两类。所以卵巢透明细胞癌也是恶性病变，治疗方法与卵巢癌相同，需要进行化疗。
如果是子宫内膜异位引发的透明细胞癌，治疗效果比高级别浆液性癌更好。而透明细胞癌可以早期发现，考虑该病由子宫内膜异位症恶变而来，所以患者应经常进行B超检查。如果B超检查发现子宫内膜异位囊肿里有突起的结节或者乳头，此时透明细胞癌可能是早期病变。而卵巢癌的疗效与早期发现密切相关，如果能够早期发 现透明细胞癌，早期即可得到治愈。