高压氧治疗不但不会导致发烧，部分中枢性高热的患者经过高压氧治疗还可以对体温调节中枢产生影响，帮助中枢性高热恢复。但是在临床工作中确实也有些发烧的病人，需要考虑是否应该让这种病人进舱，比如一些感染比较严重的病人，痰比较多，虽然在高压氧舱里有吸痰设备，但是毕竟不如在舱外吸痰方便。而且高压氧治疗需要2个小时，并且基本处于平躺的状态，翻身、拍背不如舱外方便。所以有些感染比较严重、痰比较多的病人进舱以后可能对控制感染确实造成一些影响。有些因为肺部感染发烧的病人在比较严重的情况下也会暂缓高压 氧治疗。
对于鼻饲的病人，因为高压氧治疗时需要平躺2个小时，可能会比在病房更容易造成反流，反流以后也会加重感染，容易引起发烧。这种病人也需要提前或者错后鼻饲时间，从而减少反流、误吸的几率，也减少发烧的可能。