胃肠道功能紊乱指在经过胃肠镜或其它检查之后，排除器质性疾病，诊断为一种功能性疾病。胃肠道功能紊乱的原因主要是胃肠道的神经异常，一般选用中西医结合的治疗方法。具体如下：
1、西医治疗：第一种是抑酸药物，比如泮托拉唑、奥美拉唑等。第二种是促进胃动力的药物，如莫沙必利、吗丁啉。第三种是改善肠道感受度的药物，即抗焦虑、抗抑郁药物，如黛力新；
2、中医治疗：经四诊合参后辨证论治，判断疼痛的类型，再进行细致的区分，比如胃肠道紊乱与情绪相关，可考虑是因肝郁引起，应选用柴胡疏肝散。如果是由饮食不节造成，可考虑有食积的情况，应选用保和丸 。如是肝郁脾虚等引起，可以选用相应的药物治疗。