对于腔隙性脑梗死患者，主要治疗是控制危险因素，最多是控制血压治疗，避免再次复发脑梗死，即二级预防。针对二级预防即有效控制血压，查找危险因素，定期监测血脂，血糖、复查心电图，应用抗血小板药物以及他汀类药物。在临床中最常用抗血小板药物是阿司匹林、氯吡格雷，通常单一使用即可。同时使用他汀类药物也有较多，包括阿托伐他汀、瑞舒伐他汀，以上药物均可以控制血管内膜增生，减轻动脉硬化的情况，达到预防作用。
腔隙性脑梗死通常指大脑半球或者脑干深部小穿支动脉，在长期高血压基础上血管壁发生病变，导致管腔闭塞，形成较小梗死病灶。通常腔隙 性梗死灶范围直径在2-20mm范围内，而且可以多发。部分病人可能没有临床症状，无意中做头颅CT发现有小腔梗。部分病人可以表现出急性脑梗死的发病过程，最后影像学提示是小腔梗。