碘缺乏的最大危害是影响儿童快速的生长发育，主要是影响大脑的发育，因此胎儿、新生儿、婴幼儿受缺碘的影响最大。儿童和青少年时期碘缺乏造成甲状腺素合成不足，导致甲状腺代偿性的增大，引起继发性的甲状腺肿，也就是俗称的大脖子病。
青春期甲状腺功能低下，可以引起单纯性的耳聋以及体格和智力发育障碍等。因此针对缺碘的情况，建议除了食用碘盐以外，平时饮食应该增加富含碘的食物，比如海带、海藻类等。碘是人体必需的微量元素之一，在人体内主要是参与甲状腺素的合成，所以碘的生理功能主要是通过甲状腺素的作用得以体现。甲状腺素在体内可以参与物质代谢，促进生长发育 以及调节组织中水、盐代谢等。