红霉素软膏与红霉素眼膏均可使用，两者没有本质区别。红霉素眼膏是在进行临床试验后，证明可以针对眼睛进行使用，且安全、有效。而红霉素软膏没有进行对眼睛的临床试验，所以不能确定作用于眼睛是否安全、有效。但两种药物作用在鼻腔黏膜的差别较小，因为鼻腔黏膜没有眼睛黏膜脆弱。所以只要含有抗生素成分，且没有特别刺激性的成分，不会导致鼻腔黏膜糜烂，均可以使用。
所以无论是红霉素软膏还是红霉素眼膏，在临床上应用于鼻腔没有太大差别。在使用时可以用棉签蘸一点，然后轻柔地向鼻内薄涂一层， 不要涂得太多、太用力。因为鼻腔黏膜本身也较为脆弱，如果用力可能造成损伤，导致鼻出血。另外也要注意保持室内的空气湿润，特别是在北方的冬季，建议使用加湿器。