PET-MR检查只是对掌握肿瘤情况有帮助的一种辅助检查，但不是癌症诊断的金标准，确诊癌症需要经过病理诊断。
PET-MR是一种新型影像学检查手段，精度较高，范围较广，较X光、CT安全，可以明确肿瘤定位、定量、定性、分期、敏感性。常常用来判断肿瘤性质、是否适合手术、放化疗效果、有无转移复发等，方便医生评价疗效，调整治疗方案。
PET-MR检查对于发现1mm左右的癌症有很大帮助，但是也有很大缺点，比如部分癌细胞无法拒绝脱氧葡萄糖核酸，即18F-FDG。因而正常细胞如果和癌细胞重叠，容易得到错误诊断，所以不能够过分依赖于PET-MR。