甲功五项包括甲状腺素(T4)、三碘甲状腺原氨酸(T3)、游离甲状腺素(FT4)、游离三碘甲状腺原氨酸(FT3)以及促甲状腺激素(TSH)，而甲状腺疾病包括甲状腺功能亢进症以及甲状腺功能减退。当患者存在甲状腺功能亢进症时，T3、T4、游离T3以及游离T4水平升高，TSH水平降低。当患者存在甲状腺功能减退时，T3、T4、游离T3以及游离T4水平下降，而TSH水平升高。
患者存在肝脏疾病、妊娠或服用激素的情况下，总T3以及总T4无法反映真正的甲状腺激素水平，此时需测定游离T3及游离T4水平。甲功五项中，TSH属于较为敏感的指标。若患者的T3、T4水平正常但TSH水平升高，则属 于亚临床性甲状腺功能减退症。若患者的T3、T4水平正常但TSH水平降低，则属于亚临床甲状腺功能亢进症。上述患者需定期检查甲功五项并调整药物，使相应指标恢复至正常水平。