女性上小便时存在刺痛，原因主要如下：
1、尿道炎：女性尿道毗邻阴道和肛门，所以周边常见的致病菌，如大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、变形杆菌，便容易沿着尿道外口逆向入侵进入到尿道，而造成尿道黏膜的充血、水肿、肿胀、感觉神经外露，而变得特别敏感。在排尿时，含有细菌的尿液可能刺激尿道，而在排尿时发生烧灼感、针刺感等不适感觉，患者常伴有尿频、尿急、尿痛；
2、膀胱炎：女性尿道短且直，从尿道外口到膀胱的距离较短。尿道感染很容易逆行感染膀胱，而造成女性发生膀胱炎。
在治疗方面，建议患者现进行尿常规检测，如果尿常规中发现大量白细胞，尿道炎诊断便非常明确。治疗时首推使用喹诺酮类抗生素，比如使用左氧氟沙星3-7天疗程便足够。待症状消失先别着急停药，再复查一次尿常规，直到尿常规中白细胞转阴才可放心停药，否则疾病很容易复发。