新生儿房间隔缺损一般没有特别影响，孩子的生长发育、体质、活动耐力多与正常人接近。如果缺损较大，8-10mm甚至以上的房间隔缺损，新生儿期症状不明显，但随着年龄增长，患儿常出现临床表现，如多汗、活动耐力差、明显心脏杂音。
总体而言，房间隔缺损常在学龄前和学龄期健康查体时发现，房间隔缺损较大的患儿常表现突出，特别是伴有部分性肺静脉异位引流的孩子，甚至表现为心衰、汗多、反复的呼吸道感染，建议确诊后尽早手术治疗。新生儿存在房间隔缺损时应注意保暖，出汗多的孩子应及时更换内衣，保持内衣干燥，减少患儿呼吸道感染。待孩子长大以后，根据复查评估的情况进行手术。