包皮溃疡大部分源自包皮局部细菌或其它病原微生物引起感染、炎症，也就是包皮炎或包皮龟头炎，和反复生殖器疱疹、梅毒下疳、软下疳，甚至阴茎肿瘤，都可形成包皮局部溃疡性改变。
此外性生活也可造成包皮局部摩擦和溃疡，较严重包皮龟头炎可造成包皮、龟头皮肤黏膜红肿、疼痛，合并局部溃疡，伴有炎性分泌物。
梅毒下疳多呈圆形、无痛性溃疡，境界较清楚，周围水肿并隆起，触之较硬，表面有时有浆液性分泌物。软下疳引起溃疡形态和硬下疳类似，但有明显疼痛，并质地较软。
生殖器疱疹病毒感染包皮有群簇或散在小水疱，破溃形成糜烂或溃疡，伴有疼痛。所以出现生殖器反复或久不愈合破皮，需及时到医院就诊。