先天性巨结肠术后饮食如下：
1、筛查过敏原，等待小孩入院确诊后筛查食物过敏原，对牛奶过敏的患儿根据每个婴儿个体需求，计算每日能量、水和电解质的需要量，给予相关水解蛋白奶粉进行喂养，初始喂养可采用稀释的奶液，4天内逐渐过度到全量。其他食物过敏者，按其过敏原尽量避免患儿摄入该种食物，同时对于处于哺乳期的患儿母亲也要防止摄入该种食物；
2、术后灌肠，患儿出院后，并发小肠结肠炎者应延长灌肠时间，排便后给予温生理盐水进行灌肠，直至患儿临床症状逐渐恢复，恢复后可逐渐减少灌肠次数。电话随访、术后对患儿进行为期半年，甚至更长时间的随访，应该每周进行一次，指导患儿家属掌握合理的喂养方法，注意患儿的日常饮食，并对患儿的排便反射进行训练。患儿出院后坚持服用微生态制剂，一旦发生异常应及时回院复查，尽量母乳喂养，如果不能母乳喂养吃水解蛋白的奶粉是最好的。