阴茎癌到了晚期，一般存活较差，大多数患者＜2年，具体的存活需要看患者的预期寿命，包括现在的年龄，以及体能状况、营养状况，还有更重要的是肿瘤的恶性程度，及转移的负荷。
一般如果患者出现了双侧腹股沟质硬的淋巴结转移，3年内的预期存活不会超过30%。在患者出现高危的远处转移，特别是内脏的转移，比如肺脏、肝脏转移时，预期的存活一般可能会＜1年。
如果在阴茎癌的成分中出现基底细胞癌、腺鳞癌，以及肉瘤样癌，患者的预后会变得更加糟糕。因此阴茎癌需要采用以手术为基础的综合肿瘤治疗，这样才能有望改善患者的存活时间。