脑血栓的常用检查是颅脑CT检查，可查看缺血后发生组织坏死的结构改变。当患者发生脑血栓后，通过颅脑CT检查可能无法观察到病灶，通常是由于以下情况导致：
1、急性脑血栓超早期：通常在6-72小时，尤其6小时内难以显影。当血管堵塞后，需要一段时间才会发生细胞肿胀坏死并在CT上表达。所以6小时内难以发现明确的脑血栓坏死病灶，通常在6-72小时内可能会出现模糊的显影，且需要专业人员仔细检查才能够发现；
2、微小血栓：临床上称为腔隙性脑梗死，即血栓阻塞的血管管径较小，CT检查可能难以发现；
3、特殊位置的血栓：若在后颅窝处出现血栓，由于骨头的伪影干扰，难以发现明确的血栓病灶。