朗格汉斯细胞组织细胞增生症可以影响全身多个脏器，临床上最常受累的部位是骨骼，会出现骨质破坏、眼睛突出、中耳炎等，还可发生牙齿异常。同时皮肤、黏膜也经常受累，出现脂溢性皮炎、消化道溃疡，还可出现牙龈口腔炎、肺部病变、肝脾肿大、淋巴结肿大，甚至贫血、血小板减少等。
部分患者还会出现垂体和下丘脑的病变，引起尿崩症、生长发育迟缓、性功能发育迟滞，同时伴有全身症状，比如发热、消瘦、嗜睡、激惹等。心包积液在朗格汉斯细胞组织细胞增生症患者的比例比较低，相对比较少见，但也可能是该病的临床表现之一。除此以外，个别患者可出现中枢浸润、眼部病变、胆道闭锁和上腔静脉综合征等。如果考虑到有朗格汉斯细胞组织细胞增生症的可能性，应及时到专科医院进行进一步的检查和治疗。