唇腭裂畸形对孩子未来的影响主要表现在容貌、语音、心理。唇腭裂患儿不仅在面部存在畸形，还有说话、吮吸、吞咽、呼吸、听力等重要生理的机能障碍。面部的畸形和机能障碍常常因为练习的部位、范围和程度不同有轻重的差异，除此之外现代医学更加关注的是畸形带来的心理问题，不健康的心理以及心理障碍带来的后果甚至比疾病本身更为严重。主要有以下的问题：
1、喂养困难：多数唇裂可以吮吸，对于喂养的影响较小，而腭裂患儿因为口腔和鼻腔的相通，所以不能形成口腔的负压，所以吮吸比较困难，容易呛咳或者从鼻腔里面溢出，所以喂养有一定困难；
2、营养不良：唇腭裂患儿在出生时，营养状况都是正常情况，但是由于喂养困难，患儿会发生营养摄入不足和各种营养的障碍，加上睡眠效果差所以逐渐开始消瘦出现营养不良；
3、容易罹患感冒以及上呼吸道感染的疾病：因为口腔是上呼吸道的门户，解剖结构的异常使得屏障功能减弱，冷空气和灰尘不能经过鼻腔过滤加温直接进入口腔，然后进入肺部，所以容易引起上呼吸道感染，另外唇腭裂患儿在吃奶时易误吸而导致气管炎、肺炎等，这些情况在唇裂和腭裂患儿手术完成以后就会逐渐得到改善；
4、语音发育的障碍：腭裂主要影响语言，手术效果较差、手术年龄不适，或者手术本身并没有恢复的完善腭咽壁的功能均可以影响将来的语言问题；
5、听力的影响：耳朵到咽腔有咽鼓管咽口，咽鼓管咽口在咽部的开口是腭帆张肌来调整。因为裂开肌肉连续的功能不能行使，于是长期使中耳在闭合状态，久之就容易产生渗出性中耳炎，导致听力障碍；
6、牙(牙合)畸形：牙齿排列不整齐咬合关系紊乱，是唇腭裂患者最常见的并发症之一；
7、影响面容的美观：唇裂主要表现为唇和鼻的畸形，手术修复的再好因为有瘢痕，或者手术效果不佳，红唇不整齐、不对称，或者对鼻腔的畸形的影响等，都会造成对面部容貌的影响；
8、心理障碍问题：实际上唇腭裂是一种先天畸形，常由于面部的不正常以及语音问题导致自卑、羞愧、怨恨、悲观、焦虑等。心理障碍的程度会伴随着年龄增长而逐渐增加，如果不进行心理干预，这种获得性的心理障碍可能会变为超越唇腭裂本身的疾病，是最严重的症状，所以心理治疗是终极目标。