普伐他汀和阿托伐他汀之间的不同有以下几点：
1、降脂强度不同：普伐他汀常规用量是40mg/片，阿托伐他汀常规用量是20mg/片。普伐他汀40mg，相当于中等强度的降脂，阿托伐他汀20mg相当于中等以上的强效降脂；
2、安全性不同：阿托伐他汀用量最多，肝酶和肌酶损伤可能不到1%，相较普伐他汀不良反应出现的概率较多。主要因为阿托伐他汀在体内肝脏的代谢途径是P4503A4，与很多药物代谢途径相似，容易发生药物相互不良反应，包括肌肉和肝酶损伤，但是普伐他汀并不是这条代谢途径，所以不良反应要小。
临床上有极少部分的病人，用了 阿托伐他汀之后，出现肌肉不适、肌酶升高或者肝酶升高。但是这类病人有的时候必须要用他汀类药物，临床上经常会这样处理，比如停用阿托伐他汀，试着用普伐他汀，部分不能耐受阿托伐他汀的病人，也许可以耐受普伐他汀。