在母乳性黄疸的诊断上，先要除外孩子存在其他疾病，才能考虑母乳性黄疸。所以孩子如果存在其他异常表现，这时候至少孩子不会是单纯母乳性黄疸，需要针对其他病因做相应处理。
针对母乳性黄疸，实际上并没有特别好或专有检查项目，能确认孩子是母乳性黄疸。并没有特别好的方法，判断孩子是否属于母乳性黄疸，或检查是否属于母乳性黄疸。
一般比较推荐通过停母乳的方式来确认，因为只要孩子吃母乳就会出现黄疸，而孩子一旦停母乳，没有胆红素的来源，孩子就不会再黄。因此对于母乳性黄疸的孩子，一旦停母乳，孩子黄疸3-5天会有特别明显消退或减轻。
多数孩子胆红素水平会下降在30%-50%，一旦再给孩子重新吃母乳，孩子的黄疸又会重新出现，也就是胆红素水平再升高。这种情况下，就可以考虑孩子存在母乳性黄疸。
但是目前因为停母乳这种方式，可能会影响到孩子的母乳喂养，所以目前也有推荐不停母乳，抽血检查孩子的胆红素情况，包括孩子的肝功能情况。如果孩子检查指标大致正常，可以观察等待。
一般母乳性黄疸大概在生后2-3个月，就会逐渐地自行消退。如果孩子到2-3个月之后，黄疸仍然不消退，这时候可以考虑其他的诱因，做相关的检查和处理。