高锰酸钾是一种消毒杀菌剂，可以氧化细菌体，从而起到一定的杀菌的效果。在临床上有部分的医生推荐使用高锰酸钾溶液来清洗龟头、治疗龟头炎，理论上有道理，此时一定要注意高锰酸钾的溶液不要配置的浓度过高，推荐1:5000的比例。
此时实际上看到水略微有点红即可，如果看到特别红，肯定是浓度过高，会导致整个龟头的皮肤的刺激性更强，红肿不但不会消除，反而会变得更重。
在治疗中注意事项是如果龟头的糜烂比较重，或已经出现化脓。此时就不再推荐使用高锰酸钾，因为会让龟头炎的刺激更强，不但起不到清洗的作用，反而让病变更难受，此时不推荐。
一般比较安全、有效的清理龟头炎，是用普通的温水冲洗即可，适用于各种类型的龟头炎，然后把龟头用纸巾蘸干，再抹上如红霉素眼膏、百托邦(莫匹罗星软膏)等外用杀菌剂更为妥帖。高锰酸钾使用时，注意不能配置浓度过高。