脑脓肿的穿刺抽脓手术属于微创手术，如果患者在进行手术之前，没有因为脑脓肿引起脑疝，而处于意识相对正常的状况，只是有比较严重的头痛、呕吐等颅内压增高症状。经过穿刺抽脓之后在1-2天可以有明显缓解，甚至刚刚进行穿刺抽脓之后病情就能够得到明显的缓解。
一般穿刺抽脓的手术，大概1周就可以达到恢复的标准。由于脑囊肿的患者常需要系统化的抗炎治疗，抗炎治疗周期长达数周之久，所以脑脓肿穿刺抽吸之后，患者的症状虽然在较短的时间内，能够得到明显的改善，但是仍然需要住院进行长期的抗炎治疗，才能够有效避免脓肿的复发。
另外一些患者，由于 脑脓肿引起患者发生了脑疝，进行穿刺抽吸之后意识情况以及各方面情况恢复，需要1-3周甚至更长时间，才能够逐步恢复意识、控制病情。