20%左右的癫痫病人是药物难治性癫痫，该类癫痫有可能是癫痫外科手术的指征，但不是所有的药物难治性癫痫都是外科手术指征。药物难治性癫痫是指通过多种或联合的抗癫痫药物治疗，仍不能控制发作，可以进行癫痫外科手术。对于某些有脑部异常的患者，如儿童缺血、缺氧、产伤、围生期有关的脑皮层发育不良，该类癫痫绝大部分甚至100%都是耐药性癫痫，针对该类癫痫主张早期干预。脑部如海马硬化、脑部肿瘤、继发性产伤、血管畸形、良恶性肿瘤，以上都可以通过手术进行治疗。但其原则是手术不会引起重要的功能障碍，还可以获得治愈或缓解控制的情况下才考虑手术治疗。患者及家属需要知情或能接受手术治疗。癫痫手术的禁忌症是脑部有明显广泛性弥漫性损害，包括有心肺以及各种重要脏器的功能障碍，年龄比较大的患者不能耐受。随着现在的技术发展，通过综合评估，可以明确癫痫病灶或癫痫类型，通过切除性手术或离断性手术或神经调控性手术来控制治疗或缓解癫痫。所以难治性癫痫的病人并不是无法治疗。药物难治性癫痫分两大类：
1、药物难治，要排除医源性药物难治；
2、所有的治疗手段都难控制的癫痫，是真正的难治性癫痫。无论是外科手术、调控、离断、其他手术，都不能控制的称为难治性癫痫。平时所提及的难治性癫痫指药物难治性癫痫，通过综合评估可以达到根治、控制、缓解的目的。
如果是部分起始的局灶性癫痫，病灶比较明确，通过综合评估，不位于重要功能区，便可以通过手术直接治疗。对于全部性发作或弥漫性发作癫痫，可以通过手术治疗。有一种强直发作表现为跌倒发作，可以通过离断手术如胼胝体切开，或半球离断进行控制，甚至起到控制无发作的作用，所以无论是弥漫性、全部性还是部分发作性癫痫，都可以通过手术治疗，但前提是一定要经过专业综合评估，明确发作类型、发作部位、发作病因。若癫痫手术可能会导致其他功能障碍，但不会引起严重的功能障碍，也可以考虑进行手术。所以癫痫手术并不是指局灶性癫痫可以手术，全部性癫痫不能进行手术，其实弥漫性癫痫也可以通过手术来改善和控制。