咽峡炎可以根据典型的临床表现和辅助检查加以诊断，一般包括以下两个方面：
1、临床表现：体格检查可以看到咽峡明显的充血，部分患者可以见到水肿。颌下淋巴结肿大，并且有压痛。疱疹性咽峡炎，在咽软腭后面、扁桃体等部位可以看到红色的晕斑，周围有特征性水疱疹或者白色丘疹，水疱破裂以后产生溃疡。樊尚咽峡炎者常有口臭，舌苔厚，病变部位多局限在一侧扁桃体，也可以累及腭弓、牙龈以及咽壁；
2、辅助检查：
（1）血常规检查：白细胞总数以及中性粒细胞增高，提示细菌感染，没有增高的话，可以为病毒感染；
（2）咽拭涂片：找到梭形杆菌以及樊尚螺旋体，可以确诊为樊尚咽峡炎。