脑血栓防重于治，且要分阶段而言。长期卧床、不能活动或有其它容易形成血栓原发疾病的患者，要注意下肢血栓形成，必要时进行彩色多普勒的检查。疑似脑血栓发生的患者，优先选择颅脑CT平扫，这是帮助鉴别脑出血、脑肿瘤等疾病的首选方法。对于急性小梗死病灶，优先应该选择核磁共振，患者还要进一步完善血糖、血脂、肝肾功能、电解质、心电图、心肌酶谱、血常规、凝血功能、血氧饱和度等检查，以快速确定病因与分型，便于诊治方案的制定与调整，以及对于患者预后的判定。
血栓形成时期，尤其是既往有高血压、高血脂等基础疾病的患者，平时要关注两个 部位的斑块，即颈动脉粥样斑块形成和冠状动脉粥样斑块形成，这两个部位的活动性斑块是发生脑血栓的隐形杀手，同时定期监测血压控制情况，血脂、血糖的稳定情况。对于特殊用药的患者，比如降脂药、抗凝药物、抗血小板药物的使用，要关注本身凝血、肝肾功能情况，防止肝肾功能损害及其它脏器出血。