多数炎症性肠病先进行内科治疗，出现并发症后才考虑外科治疗，这是专家的共识。因为克罗恩病提倡内科、外科联合诊治，因此手术时机，需要内科和外科共同决定，不单单由外科医生决定手术时机。总的来说手术时机，要看以下几个评估：
1、完善术前评估，进行CT肠道成像，或者MRI肠道成像、消化道造影、肠镜等排除结肠的其它病变，CT可排除腹腔脓肿、肠间脓肿；
2、进行充分的术前准备，多数克罗恩病患者的营养状态都较差，要么很消瘦，长时间饮食不良，所以首先要考虑改善营养，有些脓肿形成，包括肛周脓肿，常见考虑脓肿引流，另外也要关注肠道狭窄情况；
3、如果不需要 急诊手术，同时要控制肠道炎症，这时需要内科药物抗炎治疗，改善病变程度，同时加强肠内、肠外营养支持，改善病人的营养状态，通过内、外科共同努力，营造良好的手术状态迎接手术，术后恢复、手术效果也都事半功倍。