绝大部分的胃肠道间质瘤，发生部位是位于胃、小肠，切除的难度并没有想的那么复杂。只要早发现、早治疗，通过腹腔镜的微创切除，一般手术整个过程不超过半小时到1小时就可以完成。
对于特别小的比如胃的间质瘤，从内镜下切除也可以达到微创，腹部没有切口的目的。所以整体来看，现在切除手术的效果、风险，还有对于身体的打击是可控的。
当然如果发现的比较偏晚，没有在早期发现，发现时已经出现复发、转移，或肿物比较大，这时候如果马上采取外科手术，创伤比较大。甚至有一部分病人，可能在发现的时候是因为急症，比如消化道出血、梗阻或者是肿瘤破裂，造成腹膜炎来做手术，这时候手术难度确实就大。
所以综上，还是建议一定要早发现、早治疗，整体的风险、手术的效果、手术的难度，都会大幅度下降。
但是对于胃肠道间质瘤，发现比较困难。胃肠道间质瘤在早期的时候，整体的症状并不明显，甚至不典型，很多病人没有任何的临床表现。
但是随着这些年来去做胃肠镜常规的体检，甚至去做CT检查的时候，可以发现隐匿的，特别是位于胃的黏膜下的肿瘤，甚至在很小的时候就可以发现。
发现之后建议去找专业的医生，专业的中心去咨询，如果怀疑是胃肠道间质瘤，且位于胃部，直径超过2cm以上，以及位于其他部位无论肿瘤大小一经发现，都要积极的去干预。在比较小的时候去做，手术难度相对比较低，如果肿瘤逐渐变大，偏晚期时再来操作，手术效果差，手术风险也高。