尿道口有小肉疙瘩，通常首选手术治疗，用药辅助治疗，临床主要见于以下情况：
1、尖锐湿疣：尖锐湿疣的特点是容易在尿道外口形成多个小疣状凸起，类似于小肉疙瘩，是不洁性接触所造成，如鉴定为HPV病毒造成，疣体比较小时可用激光、冷冻方法进行治疗，如疣体较大，建议手术切除，局部外抹5-Fu(5-氟尿嘧啶)软膏辅助治疗，关键要发现全部产生疣的部位并进行物理消灭。在治疗期间注意规避性生活，避免交叉传播，推荐患者的性伴侣及时到医院检查，看是否存在尖锐湿疣；
2、尿道肉阜：女性绝经期前后容易出现，因为绝经期前后雌孕激素分泌紊乱，女性尿道外口黏膜容易增生形成息肉，以物理治疗和手术为主。如果是比较小的尿道肉阜，建议做激光烧掉，比较大的建议在局麻下用手术刀切除，然后留置尿管，通常3-4天可以康复 。