急性胆囊炎的致病菌主要来源于肠道。急性胆囊炎的主要致病菌包括大肠杆菌、厌氧菌、葡萄球菌，这一系列致病菌来源于肠道的可能性最大。当急性胆囊炎合并细菌感染时，一定要及早给予消炎药物，进行对症处理。
1、初期：主要选择广谱类的头孢或者抗厌氧菌的甲硝唑类，进行抗炎治疗；
2、后期：针对细菌进行相应培养，并且知道药敏试验结果。此时相对选用敏感的抗生素，针对性的治疗效果更佳。
肠道的细菌可以通过血行、淋巴道或者胆道逆行进入胆囊，从而引起相应的急性胆囊炎症状发作。一般首先有急性胆囊炎相关的胆汁淤积情况发生，此时更容易导致急性胆囊炎的炎症感染发作。