肛门疼痛主要由肛肠局部病变引发，不同病因对应不同的疼痛特点。
1、痔疮：痔疮是肛门疼痛常见诱因，多因久坐、便秘、饮食不健康诱发。血栓性外痔或内痔嵌顿导致的肛门疼痛尤为明显，血栓性外痔突发青紫色肿块，会导致肛门边缘肿痛；内痔嵌顿则因内痔脱出无法回纳导致胀痛，可能伴便血。可遵医嘱使用肛泰贴等外用制剂缓解疼痛。其采用中医脐疗原理，脐部给药的方式，使用方便，适用于上班族、外出人群。脐部皮肤角质层薄，血管丰富，药物能够渗透皮肤的角质层，在血液内弥散后通达患处，能凉血止血、消肿止痛，缓解痔疮引发的疼痛、出血、肿胀症状。
2、肛裂：肛裂也会导致肛门疼痛，此症状多由大便干结撕裂肛管所致，排便时会伴随剧痛，便后因肛门括约肌收缩，可能还会导致较长时间的持续肛门疼痛。治疗可选用肛泰软膏止痛修复黏膜，同时避免用力排便。
3、肛周脓肿：细菌感染会引发肛周脓肿并疼痛，主要表现为肛门周围持续性疼痛、活动时会加重，有时还会合并寒战、高热等全身表现。可在医生指导下口服头孢克肟分散片、外用红霉素软膏控制感染，若症状恶化需就医进行手术引流。
肛门疼痛患者日常需避免久坐久站，保持排便通畅，忌辛辣刺激食物。若用药后疼痛无缓解或痔疮患者出现痔核无法回纳的情况，需及时就医处理。