手足口病疫苗主要针对肠道病毒EV71型感染引起的手足口病，所以只能预防肠道病毒EV71型引起的手足口病，而引起手足口病的病毒有20多种，不可能每一种病毒均能预防。若宝宝这次感染的不是肠道病毒EV71型，而是其它的肠道病毒，则有可能会出现手足口病。手足口病多数为轻症，仅有轻微低烧，可能出现口腔的疱疹以及手、脚、臀部等皮疹。
部分宝宝会出现重症的手足口病，若得不到及时的控制，可能会引起死亡。而引起重症手足口病的病毒常见的即为EV71型，约占一半以上，死亡病例里约90%以上由肠道病毒EV71型感染引起。接种手足口病疫苗可大大减少重症手足口病 的发生，降低死亡率，尽早接种，让宝宝尽早产生免疫力，非常有必要。