肾结核治疗分为药物治疗和手术治疗，具体如下：
1、药物治疗：一般对于比较轻型的患者，首推药物治疗，常用方案如联合用药治疗方案，使用大多数需要长程治疗，即需要用药18-24个月，大多数的专家认为至少应该用药在1年。停药标准包括患者的一般状况改善，没有捂汗、低热、盗汗，排尿症状也改善，没有原来顽固的尿频、尿急、尿痛。在尿常规检测时，尿中的白细胞也转阴，在做24小时肾结核菌的鉴定和培养时，没有发现结核菌，影像学发现原来的肾结核病灶也已经出现痊愈；
2、手术治疗：当结核的肾脏病变非常严重，影响该侧肾脏功能时也可以考虑做肾脏切除手术。此时用药一般要在手术前3-6个月持续使用，在做完手术后还要持续用药1年左右，才能宣告该病治愈。