锁骨下动脉堵塞大多数与全身周围血管闭塞的病因相同，即动脉硬化导致。年龄大了之后患者因抽烟、喝酒或有高脂血症、糖尿病等高危因素，使脂质更易沉积在动脉壁上，导致锁骨下区域日积月累形成严重的狭窄，甚至再严重是闭塞，这是比较常见的原因。
有其他原因，比如大动脉炎，如有一些患者是女性，而且相对年轻，在20岁左右出现锁骨下动堵塞，这时考虑可能是大动脉炎。其他比较少见的是炎性病变，类似于风湿免疫科范畴的炎性病变，但这种炎性病变大多数通过内科治疗干预即可。还有比如在动脉狭窄严重的基础上形成急性血栓，血栓突 然把锁骨下动脉堵住，这种情况应及时把血栓取出或置管溶栓，将其溶掉，这时血管能够再恢复通畅。