蝴蝶骨疼痛的原因较多，蝴蝶骨其实是指肩胛骨，肩胛骨出现疼痛有以下几个原因：
1、肩胛骨本身原因：比如固定肩胛骨的肌肉出现损伤，导致肩胛骨运动失常，会出现肩胛骨区域疼痛，比如前锯肌损伤或斜方肌损伤，会导致肩胛骨翘起离开胸壁，运动效率下降，会导致肩胛骨区域疼痛。通常是由于支配前锯肌的胸上神经，或支配斜方肌的副神经，出现损伤导致，可以进行肌电图检查进行确诊，多种情况下可以通过康复锻炼逐渐缓解。如果康复锻炼没有效果，也可以通过肌肉转位的方式，重建肩胛骨稳定性，恢复局部的正常功能，疼痛也就消失；
2、肩关节疾病：比如肩关节的冻结肩，肩峰下撞击综合征、肩袖肌腱的撕裂等，都会经常性引起冈上肌、冈下肌和小圆肌的炎症反应和肌肉疼痛，这些肌肉都附着在肩胛骨背侧，感觉上就是肩胛骨背侧骨头疼痛。对于肩关节进行治疗，包括对于炎症反应进行封闭注射抗炎治疗，对于肩袖肌腱进行修复，肌腱愈合之后，再进行肩关节的康复锻炼，都可以获得肩关节的功能恢复。肩关节恢复好之后，肩胛骨的功能正常，疼痛也会消失。