治疗肠胃胀气，首先要明确原因。如果排除肝脏、肾脏或者全身其它疾病，明确仅为胃肠道功能障碍，可以给予药物治疗。肠胃胀气最常见的原因是肠道菌群紊乱，可通过喝酸奶或者服用益生菌来改善。如果患者单纯服用益生菌并不能改善，可加用助消化的药物，比如中药木香顺气丸、四磨汤。
如果胃肠胀气是对某些食物不耐受引起，比如很多患者存在乳糖不耐受，所以喝牛奶后会引起胀气，应减少或避免这种食物的摄入。如果是因饮食结构不正常引起，比如患者过多摄入肉等蛋白质食物，由于蛋白质代谢的问题，可以在肠中产生大量的气体而引起腹胀，这时应改善饮食结构。