颅骨可能会由于个体发育原因，而存在凹凸不平或局部凹陷的情况，但此类凹陷形成时间较长，甚至在患者逐渐发育过程中形成。若患者突然出现颅骨凹陷，且凹陷与周围颅骨硬度不同，触压时存在局部疼痛，甚至整个头颅疼痛，应引起重视。
颅骨病变通常可以形成颅骨局部凹陷，尤其在局部颅骨发生破坏后，被软组织所替代时，由于软组织硬度不够，在触摸时会发生局部凹陷，以及疼痛、压痛。对于短时间内形成的颅骨凹陷，患者应及时到医院就诊，必要时进行头颅CT骨成像甚至头颅磁共振检查，以明确病变具体性质。若是由于病理性原因引起颅骨凹陷，患者需考虑通过神经外科手术的方式切除病变。