颅骨修补术是神经外科用于治疗颅骨缺损的一种手术方式，通常颅骨修补术较安全。但是根据患者具体情况不同，可能会出现一系列并发症，包括钛板的排异反应、钛板下积液、切口愈合不良乃至切口感染、癫痫发作以及颅骨修补术后的神经功能障碍加重。
患者颅骨修补术后可能发生肢体活动不利、肢体力量减弱，严重时可能发生偏瘫，也可能会使患者出现一定程度的失语，特别是进行左侧颅骨修补术后，患者存在发生失语的可能性，因为大多数患者的语言中枢位于左侧大脑半球。此外在长期的观察过程中，部分患者还会出现颅骨的钛板穿破头皮，造成钛板外露的情况，此时也容易造成颅骨修补术失败和伤口感染，个别严重的患者还可能会出现感染波及颅内的情况。
虽然颅骨修补术整体上较安全，但是根据患者的具体情况也有可能会出现并发症，应该在围手术期注意严密观察。