造成先天性心脏病的原因主要如下：
1、胎儿周围的环境因素：孩子在妈妈肚子里受到病毒感染，即宫内感染，如风疹病毒、柯萨奇病毒以及其它病毒，均可对胎儿心脏的发育造成影响，产生畸形。此外，胎儿受到压迫、母体存在营养障碍或维生素缺乏等代谢病，母体使用过细胞毒性药物以及长时间接受放射性照射等，均可能导致先天性心脏病；
2、遗传因素：与先心病相关的21-三体综合征、18-三体综合征、威廉姆斯综合征，均可能表现为主动脉瓣狭窄和肺动脉分支狭窄，同时马凡氏综合征也会造成孩子心脏畸形。5%的 先心病患者发生于同一家族，病种相同或近似，该现象也证实了遗传因素的影响；
3、缺氧：高原的很多孩子会出现动脉导管未闭，因缺氧导致动脉导管较难关闭，因此先心病的发生率非常高；
4、性别、母体高龄、母体喝酒抽烟等因素也会产生一定影响。