百多邦通常用于治疗急性细菌性表浅性龟头炎，临床疗效可靠，但应明确此类龟头炎是细菌感染造成。如果龟头炎是由于真菌感染所致，特征性表现为包皮龟头上有难洗干净的白色污垢，龟头处瘙痒感较重，如果做病原微生物鉴定后发现有真菌菌丝或孢子，则不能应用百多邦，通常建议使用克霉唑类抗真菌软膏。
大多数包皮龟头炎患者均是由于包皮垢内的大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、变形杆菌感染造成，而百多邦属于抗生素软膏，比较适合急性细菌性表浅性龟头炎。建议按药品说明书或医嘱进行使用，常规疗程后龟头炎停止瘙痒，且局部皮肤颜色、皮损恢复正常，则证明治疗有效，如果患者有包茎或反复包皮炎，则建议尽早做包皮环切手术进行治疗。