睡起来后脑勺疼通常由睡姿不当导致，但也可能与患有颈椎病、高血压、偏头痛、枕神经痛等疾病有关，不同的原因治疗方式不同。
1、睡姿不当：若睡觉时长时间保持不当的睡眠姿势，或枕头高度不合适，导致后枕部与颈部长时间处于悬吊状态，容易引起局部肌肉受到牵拉，就可能会造成睡觉起来后脑勺疼。对此可在局部进行按摩、热敷，可以使肌肉得到放松，改善上述症状。
2、颈椎病：如果存在颈椎病，突出的椎间盘压迫局部血管、神经根，造成椎基底动脉供血不足，就可能会引起睡觉起来后脑勺疼，还可能会伴有头晕、颈部僵硬、酸痛等症状。对此可遵医嘱应用塞来昔布胶囊、颈复康颗粒等药物，并配合局部按摩、热敷、牵引治疗等方式改善症状。
3、高血压：主要由遗传、肥胖等因素导致，由于患者血压控制不稳定，早上起来后血压升高，进而引起睡觉起来后脑勺疼，主要由血压升高导致的脑血管内部压力升高引起，并伴有四肢麻木、胸闷等症状。对此可遵医嘱使用硝苯地平控释片、氨氯地平片等降压药物治疗。
4、偏头痛：可能由遗传、内分泌代谢异常等引起，如果患有偏头痛，并且在晚上熬夜或着凉，可能会在早上诱发偏头痛发作，进而引起睡觉起来后脑勺疼，并伴有恶心、呕吐等症状。对此可遵医嘱应用布洛芬胶囊、对乙酰氨基酚片等药物治疗，缓解上述症状。若效果不佳，则需要考虑应用曲坦类的药物治疗，比如琥珀酸舒马曲普坦片、苯甲酸利扎曲普坦片等。
5、枕神经痛：如果在晚上睡觉时存在长时间睡眠姿势不良、受凉等因素，容易刺激神经，诱发枕神经痛发作，就可能会引起睡觉起来后脑勺疼，且疼痛多为针刺样、撕裂样疼痛。对此可遵医嘱应用卡马西平片、加巴喷丁胶囊等药物治疗。
除此之外，患者出现睡起来后脑勺疼的症状，还可能与患有自发性蛛网膜腔下出血、脑动脉硬化、睡眠呼吸暂停低通气综合征、上呼吸道感染、后颅窝肿瘤、带状疱疹等疾病有关。建议患者前往神经内科就诊，完善X线、CT等相关检查，以明确具体原因，并积极配合医生治疗。