出现早上起床口水黏稠和黄褐色的情况，可能是由于口腔卫生差等非疾病因素导致，也可能是牙龈炎、牙周炎、牙龈出血、病毒性感冒、胃食管反流、鼻炎等疾病因素造成，应在医生指导下进行针对性治疗。
一、非疾病因素：
如果自身的口腔卫生较差，没有及时刷牙或漱口，吃了太多油腻食物，如油条，食物残渣在口腔中发酵，就会导致早上起床口水黏稠，呈黄褐色，建议患者做好自身的卫生清洁，勤刷牙、勤漱口，少吃油腻食物。
二、疾病因素：
1、牙龈炎：当患者患有牙龈炎时，牙龈在轻微外力作用下会出血，如果患者的牙龈在夜间出血，血液在夜间被氧化，导致患者早上起床口水黏稠，且呈黄褐色。通常可以遵医嘱应用抗菌药物，如甲硝唑，可以起到抗炎的作用，缓解肿胀、疼痛的症状，对于存在牙龈增生，以及在炎症消退后牙龈形态不能恢复正常的患者，可能需要进行牙龈成型手术来矫正。
2、牙周炎：若自身出现了牙周炎，牙龈部位肿胀，牙菌斑侵蚀牙周组织，就会导致牙周袋溢脓或者出现牙齿松动、牙龈红肿等现象，脓性分泌物与唾液混合，会出现早上起床口水黏稠、黄褐色的情况。患者可以在医生指导下服用甲硝唑片、罗红霉素胶囊等药物治疗，也可以在医生指导下选择手术治疗，比如切开引流手术等。
3、牙龈出血：如果患者刷牙的时候用力过度或者是牙根松动，可导致牙龈出血，血液混合唾液就会出现口水黏稠的情况，可出现早上起床口水黏稠、黄褐色，患者可以在医生指导下使用云南白药胶囊、醋酸氯己定溶液等药物缓解。
4、病毒性感冒：是由于病毒感染而引起，如果患者出现了病毒性感冒，伴有上呼吸道感染症状，比如咳嗽、咳痰、发热等，可对咽喉部位造成刺激，也会导致脓性分泌物增多，可出现口水黏稠和黄褐色的痰液，建议患者在医生指导下服用药物治疗，比如利巴韦林胶囊、磷酸奥司他韦颗粒、布洛芬胶囊等。
5、胃食管反流：可能是食管下括约肌功能障碍和食管体部运动异常导致，患者会出现反酸、恶心、呕吐等症状，呕吐物残留于口腔中，也会导致早上起床口水黏稠，呈黄褐色的情况，患者可以服用奥美拉唑肠溶片、多潘立酮片等药物治疗。
6、鼻炎：通常是由于病毒、细菌、变应原、各种理化因子等因素引起的鼻腔黏膜炎症，由于炎症刺激可导致鼻腔分泌物增多，此时擦鼻涕的次数也会增多，容易使鼻腔内毛细血管破裂，导致血液回流到口腔中，口腔中的血液氧化后会呈现黄褐色，容易引起早上起床口水黏稠，表现为黄褐色的现象，患者可以在医生指导下服用辛夷鼻炎丸、通窍鼻炎颗粒等药物进行治疗。
7、慢性咽喉炎：通常是由于急性咽喉炎发展而来，可对咽喉部位产生刺激，咽喉部位的黏膜充血时可能会有血液渗出，血液混合到口水中，便会出现早上起床口水黏稠、黄褐色的情况，患者可以在医生指导下使用桂林西瓜霜含片、银黄含片、复方熊胆薄荷含片等药物进行治疗。
8、其他原因：早上起床口水粘稠和黄褐色也可能是由于阴虚火旺(体内阴精亏损，出现虚火亢盛)导致，由于阴虚火旺的体质导致口腔黏膜失去了津液濡养，当口水少了患者会自觉口水黏稠咽不尽，而且口水的颜色也会出现异常，通常可以遵医嘱应用知柏地黄丸、百合固金丸等药物进行治疗。
若早上起床口水黏稠、黄褐色的情况不能缓解，建议及时前往医院口腔科就诊，完善视诊、喉镜、血常规等检查，在医生指导下查明具体的病因，以免延误治疗。